Sonic Gems Collection — компиляция редких сониковских игр, вышедшая только на Nintendo GameCube в США, но также портированная на Sony PlayStation 2 для Европы и Японии. Задумывалась и версия для Microsoft Xbox, но позже она была отменена. Основные игры компиляции:
Sonic the Hedgehog CD
Sonic the Fighters
Sonic R

Ещё в сборнике есть 6 игр с Sega Game Gear, отсутствующих в Mega Collection+:
Sonic the Hedgehog 2
Sonic Spinball
Sonic Triple Trouble
Sonic Drift 2
Tails' Skypatrol
Tails Adventure

В компиляцию включены оригинальные мануалы к каждой игре. Также имеется "музей", где можно разблокировать различные арты и скриншоты сониковских игр, ремиксы музыки и "демо" версии игр из Sonic Mega Collection Plus, которые автоматически начинаются с последнего уровня или финального босса.